成吉思汗率領中路軍直撲花剌子模重鎮兼新都撒馬爾罕 (Samarkand)，在城外五里之遙駐紮大軍。他先以人盾戰術挑釁守城軍，試探他們的虛實。只見手無寸鐵、男女老幼的俘虜被繩索綁在一起，在進攻的蒙古大軍前面被押往前推進，守城軍的箭如雨點灑落在這些俘虜身上，俘虜紛紛慘叫倒地，哭聲震天，部分守城的花剌子模士兵看到這種殘忍的戰術，不禁放下弓箭。
翌日，成吉思汗命令千夫長也速不花帶士兵到城下挑釁，必須要誘敵出城門交戰，一接觸後必須要邊戰邊退，並留下兵器，顯示敗軍退卻混亂之像。蘇丹摩訶末在城樓上督戰，看到蒙古兵不堪一擊，不禁哈哈大笑：「蒙古兵不過如此，下次再迎戰，我們大軍盡出，放出戰象，把所謂的蒙古大軍踏平。」
經過幾天試戰之後，成吉思汗下令休戰，只圍不攻，並召集他派出喬裝成平民的偵察兵和熟悉撒馬爾罕城的商人聽取他們的報告，領頭的偵察兵說：「撒馬爾罕城池在山丘之上，易守難攻，而且城池較不花剌堅固，分為城堡，內城及外城三個部分，蘇丹摩訶末仍然留守在城內激勵軍隊士氣。此外，他聘用了三萬突厥僱傭兵協助守城，連同城中守將有將近十萬人。」
耶律楚齊也上前匯報：「軍隊的工匠團隊，已研發了一種有著精密機關會自動發射的十字弩機，我已下令今夜工匠指示俘虜在距離城數百米外的地方，連夜掘出多條土坑，將長長的鐵片接駁起來放進坑中並覆蓋泥土，然後在末端設置一個機關，只要敵人踩踏機關上面的泥土，就會經鐵片觸動弩機的發射裝置，弩機就會自動發射。」成吉思汗聽後說：「好，我們三天後攻城。」
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千夫長也速不花再次帶領士兵到城下挑釁，蘇丹摩訶末親自督軍帶著步兵、騎兵、戰象開城追擊蒙古軍，也速不花馬上帶領蒙古將士後撤，蘇丹摩訶末正要哈哈大笑，譏諷蒙軍臨陣退縮時，他們卻踩中弩機的機關，被自動發射的強力箭弩射近穿盔甲慘死。蒙軍此時才真正出擊，投擲燃燒的火球，外圍再設置一排強力弩機，以強勁的遠攻戰術痛擊敵軍，即使是身型龐大的戰象，被強弩刺進身體後，也哀號一聲痛苦倒地。
花剌子模軍頓時陣腳大亂，蘇丹摩訶末眼見自己的將士一個個倒下，急急策馬轉身狂奔，背棄國民逃離，三萬名突厥僱傭兵，自知不是蒙古軍的對手，背叛撒馬爾罕人民，擅自開城門向蒙古軍投降，更列隊歡迎蒙古軍進城。他們的做法不但令城中人民憤怒，也觸怒了生平最痛恨背叛的成吉思汗。
成吉思汗讓軍隊進城後，第一時間屠殺了這三萬名突厥僱傭兵，並將屍體全部抬到城外，任由野生動物噬咬。至於城內數以十萬計的平民，知道在不花剌城的事後，紛紛向蒙古軍獻上最珍貴的物品換取不被屠殺，成吉思汗在處決三萬突厥僱傭兵後，認為這些人的生命取代部分撒馬爾罕人民，他指示與伊斯蘭教長有關係的五萬人可留在城內，其他有能力的工匠或學者，收編在軍隊中。
至於其他沒有抵抗的平民，年輕力壯的會被分予蒙古貴族當奴隸。成吉思汗聽從拉濟勸告，沒有破壞伊斯蘭文化，保留了具特歷史意義的一些建築物。
伊斯蘭教長安排不同階層的人民，向蒙古國獻上他們最有價值的物品，除了寶石外，還有絲綢、布匹，葡萄酒以至雕刻品等。而成吉思汗眼見鎮民都順從，也希望在這城鎮中稍作休息，等待他早年邀請的大人物到臨。
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成吉思汗召喚最愛的孫兒木阿禿干來到他的大帳中，他是成吉思汗二子察合台的嫡長子，是未來將中原納入蒙古帝國版圖創立元朝的元世祖忽必烈的堂兄，忽必烈比他小十二歲。成吉思汗自覺年事已高，力氣有所不逮，特別那次和菲歷架鬥竟然沒法戰勝。他一直在思考自己四個嫡子是否延續蒙古帝國的最佳繼承人，加上成吉思汗長子朮赤是否自己親生的是一個大問號，所以二子察合台的嫡長子木阿禿干是自己王國最理想的繼承人。
木阿禿幹自幼機靈好學，箭騎摔跤無一不精，十一二歲，已是一幫堂兄弟中的領袖，帶領他們圍捕野狼獵物的時候指揮有道，十三歲在博克摔跤中已獲得蒙古第一勇士的稱號，是成吉思汗孫兒輩的表表者。十五歲的他，在進攻花剌子模的各次戰役中，衝鋒陷陣、身先士卒，在策劃戰役中運籌帷幄，在成吉思汗眼中絕對是智勇雙全。木阿禿干為人性格誠懇厚重，是當大汗的絕佳人選，深受成吉思汗痛愛，並銳意栽培。
蒙古人認為打雷是上天憤怒，所以蒙古人都害怕打雷，包括戰士，聽到打雷都縮在地上不敢站起來走路。木阿禿干帶領的軍隊在花剌子模一場戰役中，雙方兵馬兩陣對圓，廝殺即時要展開時，天氣忽然大變，戰場上烏雲密佈，接著打雷閃電不斷，這時蒙古士兵嚇得都停了下來，蹲在地上不敢動。但是木阿禿干卻站立於雷電之下，如戰神降世，他的勇氣感染了他的軍隊。士兵們和他一樣在雷電交加的雲層下奮勇向前衝向敵陣，最終贏得了這場戰役。
「木阿禿干，你就留在爺爺身邊的部隊，攻城陷陣，指揮整個花剌子模戰役。」成吉思汗與孫兒坐在一起，一邊享用葡萄，一邊拍著他的肩膀說。
「父汗要我隨他部隊在西部進軍呢，其實我也想留下來跟爺爺學習。」木阿禿干順手拿了一串葡萄在吃著。
成吉思汗輕拍他的肩膀，豪邁地大笑了兩聲，然後道：「我跟你父親說就可以了，再吃點葡萄吧！」
「爺爺，我希望像你那樣征戰四方，將蒙古國變得更偉大！」木阿禿干向成吉思汗道，說得極有自信。
「我就是喜歡你的英雄大志，我的眼光不會錯的，我將來回到長生天以後，你將來一定比你父汗，甚至比我更偉大！」成吉思汗看著仍然一臉稚氣，卻有著鴻圖偉略的孫兒，心裡滿是安慰。
「爺爺你不會離開的，你會長生不老，」 英姿勃發一個堂堂男子漢，畢竟只是一個十五歲的的木阿禿干竟然撒嬌的對成吉思汗說。
他們兩爺孫相處了一整個下午，直至木阿禿干父親察合台來到接他，成吉思汗才放木阿禿干回去。
成吉思汗對兒子察合台說，希望把木阿禿干留在他身邊，由他親自訓練及培育他成為一個偉大戰士，定必可以將蒙古版圖進一步擴大。
察合台聽從父親的命令，同意把木阿禿干留下來。
成吉思汗安排木阿禿干住進他旁邊的帳篷，希望在這段戰火暫緩的期間，能夠每日都能與愛孫相處。木阿禿干答應了，說只要爺爺喜歡，他留多久也可以。
木阿禿干逗得成吉思汗很快樂，讓成吉思汗在花剌子模戰火中享受爺孫之樂，在二人相處的這段期間，更鞏固了成吉思汗認為木阿禿干是蒙古帝國未來的想法。
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耶律楚材等人成功遊說成吉思汗，避免一場又一場的血腥殺戮。成吉思汗下令不得殺害任何一個已投降的平民，蒙古軍隊漸漸減少沒有意義的殺戮，甚至放過投降的敵軍。
成吉思汗並沒有出征，只留在大帳休息，聽取將士匯報最新形勢。得知撒馬爾罕已被蒙古軍全面接管後，決定犒賞大功之士。正當他宣布誰人獲得賞賜之時，門外突然有人跑著衝進來，氣急敗壞地向成吉思汗嚷道：「訶額侖太后回到長生天了！」
原本心情正好的成吉思汗，聽到這噩耗，突然身體向後一跌，失平衡坐在地上，忽蘭及一眾大將馬上上前攙扶。來告信的士兵原來連夜趕路，不斷換馬，四千多公里的路，他二十天就走完，來到花剌子模向成吉思汗報告訶額侖的死訊後，他已累得癱瘓在地上。
一度昏厥的成吉思汗恢復過來後，他語帶悲傷地問士兵：「阿媽她有說什麼嗎，阿媽她去得安詳嗎？」
胡亂吃過乾糧和喝了點水後，這個士兵定過神來：「太后臨終前有孛兒帖及其他妃子及子孫陪伴在側，只是她一直氣若游絲的叫著大汗的名字，說鐵木真怎麼還不回來，鐵木真怎麼還不回來?」
成吉思汗像靈魂出竅雙目呆滯，抬頭定神望著大帳的頂部，默不作聲，不久右面眼角就滲出了一滴眼淚。突然成吉思汗哇的一聲吐了一口鮮血，眾人大驚，趕緊往大汗撲去。見嗔已閃身趨前，出掌先拍打大汗的上焦各穴位，右手即扣住大汗手腕上的陽池列缺穴，左右再連點雲門中府穴。
之後，成吉思汗神不守舍地推開眾人，步履不穩的走出他的大帳。他面朝東面，雙膝跪在地上，頭緊貼著地面，眾人只看到幾滴淚水掉在乾涸的土地上。眾人都不敢發一言一語，然後大汗掙扎的站了起來，蹣跚的緩步走回大帳，並揮手叫眾人離開。
帳外，見嗔才說：「我日前感應到大汗將遇到極度悲傷的事，沒想到是太后駕崩，所以我叫眾人注意他的肺部，悲傷肺就是這個意思。我剛才已在他的手太陰肺經發了點功，希望能止住他的血，並舒解他的鬱結，但他對太后逝世的悲是旁人是沒法化解的，對親人思念的癡是要大汗自己頓悟了。不過，我恐怕這些事會接踵而來。」
著著在大帳中，成吉思汗跪在地上，合上雙眼，腦海不斷浮起兒時訶額侖帶著年幼的他和一眾兄妹，在深山靠吃野菜及樹根過活的苦日子。母親對他的教導及刻苦，是他成為如今的舉世英雄的最大動力。
他又想起當年一家落難時，在聖山不兒罕合勒敦山上，對著母親立下宏願，要將蒙古大軍帶到看得到甚至看不到的地方，訶額侖只輕輕的說了一句：「你要好好對待蒙古族的人，停止各部落的人互相殺戮。」
母親的囑咐成吉思汗今天已經一一做到了，但母親卻在萬里之外的蒙古草原去世，他甚至無法見母親最後一面，無法親自為她舉葬，他多麼希望世上有長生不老之術。
成吉思汗把自己關在大帳裡足足一個下午，直至天色漸黑後，忽蘭揭開幕門進來，讓他好好的擁抱一下自己，讓他將悲傷透過擁抱而傳送一些給自己，她希望能夠分擔他的哀痛。
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