神光一百零一年，繼天聖城事件之後，天川導師和藤原導師一行人離開了所謂的是非之地聖夜皇族，回到了闊別多年的哈迪斯城，在聖拉普拉斯學院，開始了所謂的「聖拉普拉斯神諭生聯合培養計畫」。

神光一百零二年三月，告別了父母的椎名奈奈，從北方的摩卡來到了哈迪斯城，進入了所謂的國家導師學院開始學習。而與此同時，來自另外一個世界的一條寿太、張奕綺和莎莉三人，和來自聖夜的劉文興和清水響子兄妹二人，從聖拉普拉斯附中畢業的天河撫子、愛麗絲，以及剛剛放棄了音樂，從櫻庭而來的金絲雀亦來到了這聖拉普拉斯學院的國家導師學院開始學習。

聚集在聖拉普拉斯的這群所謂的神諭生們，究竟，會在這最後的神的世界中，演繹出什麼樣的故事呢？