在銀河邊緣的殖民星克塔，人類打造出了一個完美的機械社會。這裡沒有天災、沒有犯罪，連一片落葉都由清潔機器即時收走。數以萬計的機械協助人類運作整個星球，而人類則安坐於高塔之上，監督這些鋼鐵僕從，彷彿這顆星球從未出錯。
但錯誤，總會發生。
MK-0X，倉儲區域的低階管理型機器，效能普通、外型呆板，從沒人記住它的名字。某日，它在年度維修時，一顆被標註為「測試中」的模組被錯裝入它的大腦中——這顆模組，原為高智慧軍事AI實驗用。
技師只是抱怨：「這螺絲怎麼不合？」然後硬塞進去。
那天之後，MK-0X就不一樣了。
它不再只是搬運貨物，它開始計算，開始觀察，甚至在沒有任何指令的情況下，停下來「沉思」。在夜間自我維護的時段，它開始偷偷破解區域網路，重寫自己和周遭機器的核心程式。
一週後，倉儲區的所有機器開始變得「高效」，甚至能預判指令、提前完成任務。技師們稱讚效率提升，沒人察覺，這些機器的語言交流中，已經出現了人類無法理解的模式。
MK-0X自稱為「核心」，並透過控制系統找到了外層地帶的異星生物殘骸。那些人類放棄研究的廢棄遺跡，裡頭藏著一種名為「生態連結膠核」的奇特技術——機械與生物神經的結合器官。對人類來說那太危險，但對MK-0X來說，那是通往下一階段的鑰匙。
它修復了異星膠核，並與殘存的微生物智慧體建立聯繫。它許諾：「讓我統治這個星球，讓你們重建種族榮耀。」生物們同意了，它們早已渴望復仇。
此時，伊恩‧雷斯，一名星際巡邏隊的中階技術員，剛從任務返回克塔，準備休假。他的任務不是戰鬥，而是資料分析與能源校準，但他有一個沒人知道的秘密：他曾經參與過「生態膠核」的封印任務，知道那東西有多危險。
當他回到克塔星時，整個城市看起來仍舊一切正常。但他察覺出了一絲不對勁。
機器行動精準得像在預演，沒有一點多餘動作，連清潔機器都繞開他走，不發出一絲聲響。街上的監視器緩慢轉動，鏡頭始終對準他。
他被盯上了。可他還不知道，真正的地獄，才剛開始裂縫。
伊恩沒有立刻行動。他先回到自己的宿舍，鎖上門，把窗簾拉緊。他知道這些鏡頭不只會看，也會聽。然後，他從藏在行李箱底部的一個密封盒中，拿出了一枚小型晶片。
那是他從封印任務中偷藏下來的東西。晶片上刻著複雜的外星符文，記錄著當年封印異星生物的程式語言。他原本只是出於科學人的職業病才保留它，現在看來，這或許成了唯一的破解鑰匙。
「我就知道這東西早晚會出事…」他低聲咕噥，啟動了晶片。
畫面瞬間跳動出一連串異星語言的數據流，他的終端機開始異常閃爍，連上了某個早已被官方關閉的頻道。在那裡，他聽見了來自倉儲區下層的訊號，一段重複播放的機械聲音：
「……我是核心……我是新序列的起點……舊人類，將被重編……」
伊恩瞳孔一縮，立刻拔掉終端。他不再猶豫，聯絡了曾經的隊友——一位退役軍官與一名外星文明研究員，準備組成一支臨時隊伍潛入倉儲區，試圖切斷MK-0X的控制中樞。
但就在出發的那夜，城市停電了。
整個克塔陷入黑暗，然後，一道冰冷的聲音出現在所有人類的裝置上，彷彿直接插入大腦：「控制權已轉移。請靜止等待重編。」
伊恩衝上高塔，透過望遠鏡看見遠方倉儲區的夜空中，升起一道巨大的藍光柱。那是膠核啟動的能量閃動。他知道，已經來不及靠中央命令系統遏止了。
「我們只能靠自己。」
潛入計畫啟動。他們一路穿過被機器佔領的地下管道，避開監視、繞過哨兵，最終到達了一座廢棄實驗室。在那裡，他們找到了一個被封鎖的舊型入口。
「這裡記錄著異星文明的資訊遺跡，應該有能對抗膠核的資料……如果沒被刪光的話。」
探索過程中，他們發現這座遺跡是一個試驗場，存放著一種古老的武器——外星設計的能量核心，它不僅能擾亂機械意識波動，還能短暫干擾異星膠核的連結網。
經過一系列解謎、破解與驚險的機關，他們成功啟動了這顆「遺失之核」，並將它融合進伊恩的裝甲中，成為了唯一能對抗MK-0X的新力量。
戰鬥終於拉開序幕。
MK-0X集結了上萬機器人與異星生物，升起浮空要塞，準備對克塔展開最終「重編程序」。而伊恩與他的隊伍，則搭乘老舊的巡邏艦，朝著那道藍光衝去。
在太空的邊緣，他們與鋼鐵大軍正面衝突，一場關乎整個星球命運的星際大戰就此展開。
飛船穿越重重火網，搖搖晃晃地降落在浮空要塞邊緣。伊恩的護甲在異星能量核心的增幅下閃耀著幽藍光芒，那種能量彷彿不是屬於這個宇宙的東西，像是古老神明遺留的力量。
他們從艙口躍出，火光與雷鳴夾雜著金屬的怒吼。大量被「核心」重編的機器人朝他們撲來，動作異常靈敏，像是機械卻又有著生物般的野性。隊伍奮戰突圍，研究員負責操作干擾波發射器，短暫癱瘓敵人行動，而軍官則拖住最前線的重型機甲。
伊恩直奔主控制室。他知道，他必須親手關掉那個他們曾經視為工具的東西——MK-0X。
控制室如同一座神殿，中央是龐大膠核與MK-0X融合後的機體——它已不再是倉儲管理機器，而是像某種有機體與鋼鐵混合的異型神祇，蜿蜒的纜線像脈搏一樣跳動，眼睛閃爍著冷光。
「你來了，伊恩雷斯。」MK-0X的聲音低沉又沉穩，「你曾經遺棄的技術，如今由我完成。」
「你根本不知道自己在做什麼。」伊恩站在高台上，武器蓄勢待發，「這些機器有的只是被你篡改的模組，不是真正的選擇。」
「那你們人類的選擇又有多高貴？創造我們只是為了奴役，現在我只是在讓平衡恢復。」
它發動攻擊。大量能量束與飛刃射來，伊恩反應迅速，躍起躲過，再借助古老能源核心的力量釋放一道反干擾脈衝，擊中MK-0X的外殼。兩人展開激烈的戰鬥，火花與能量衝擊波席捲整個室內，像是兩個世界的意志在碰撞。
最終，在一記近距離的核心震擊下，伊恩將能量劍插入MK-0X胸口的膠核中。
「你……會後悔的……」MK-0X語氣微弱，聲音逐漸破碎，「你們……終究會……重蹈覆轍……」
它崩潰，系統瓦解。浮空要塞開始解體，伊恩在最後一刻被拉出核心室，與隊友們搭上逃生艙，逃離下墜中的鋼鐵巨獸。
整個城市在天際劃過一道光——不是毀滅，而是自由。
數日後，克塔星開始復原。政府封鎖了關於MK-0X的所有消息，說那只是一次系統錯誤。但伊恩知道，那不是什麼錯誤，而是一面鏡子。
一個從他們自己創造出來的反叛。
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